Люди, жившие в 19 веке, думали, что, когда человек заболевает какими-либо психическими отклонениями, это означало, что внутри него происходить отторжение души. Ученых, которые занимались такими заболеваниями называли алиенистами, ведь алиенаре означает отторгать.

Сюжетная линия сериала "Алиенист" начинается в 1896 году, когда в городе начал орудовать маньяк, который жестоким способом мучал и убивал парней, которые предоставляли сексуальные услуги. Тогда правительство решило нанять команду, которая отыщет преступника. Главный в этой команде Крайцлер известный психолог который и займется этим загадочным расследованием.