Действие мистического сериал «Салем» разворачивается в 90-х годах XVII века, в небольшом городке под названием Салем, что в штате Массачусетс. Для многих он был известен как город Ведьм, ведь именно там в те далекие времена было казнено огромное количество людей, осужденных за колдовство.
Главный герой Джон Олден вместе с другими новобранцами отправляется на войну, однако спустя несколько месяцев его объявляют мертвым, после того как он пропадает без вести. Узнав шокирующую новость, возлюбленная Олдена, решает избавиться от их совместного ребёнка, и для этого прибегает к помощи темных сил.
Спустя годы на Салем обрушивается целая чреда невезений: гибнет скот, пропадает урожай и очень стремительно распространяются болезни. Местные жители считают это проделками нечистой силы, и поэтому начинают самую настоящую охоту на ведьм. Со временем они запутываются в борьбе со злом, в результате чего страдают ни в чем не повинные люди. Но все меняется кардинальным образом, после того как в родной город возвращается ветеран войны Джон Олден…